Nörotransmiterler beynin çeşitli kısımlarının kendi içerisinde ya da birbirleri ile iletişim kurmasını düzenleyen biyokimyasal yapılardır.

Nörotransmiterler içerisinde depresif bozukluklarla en çok ilişkili bulunanlar serotonin, dopamin ve norepinefrinlerden oluşur.

Serotonin duygusal tepkileri kontrol eder, fazlası huzur ve iyimserlik ile ilişkilidir. Eğer serotonin seviyesi diğer nörotransmiterlerin seviyesinden düşük ise duygu durum bozuklukları görülebilmektedir.

Kronik stresin ise haz ve ödül deneyiminde önemli rol oynayan dopaminin seviyesini düşürerek depresif belirtilere neden olduğu gözlemlenmiştir.

Norepinefrin, beynin dikkat ve çevreye yanıt verme ile ilgili bölümlerini etkiler. Kalp atım hızını, depolardan glikoz salınımını ve iskelet kaslarına giden kan akımını artırarak “kaç ya da savaş” (flight or fight) yanıtının temelini oluşturur.